ケニア国立博物館は、ケニアの博物館、遺跡、記念物を管理する公共団体である。古生物学、民族誌学および生物多様性の研究と保全を行い、東アフリカにおける文化研究の中心となっている。その本部とナイロビ国立博物館はナイロビ中心地からほど近いMuseum Hill地区にある。ケニア国立博物館は、東アフリカ自然史協会（EANHS）によって、東アフリカの動植物の生息環境の科学的調査を実施することを目的として、1910年に設立され、今日では、ナイロビ国立博物館以外に21の地域博物館およびケニア国内の多くの遺跡や記念物を管理している。
ケニア国立博物館によって運営されているナイロビ国立博物館以外の博物館は以下の通りである。
