欧州原子核研究機構（おうしゅうげんしかくけんきゅうきこう、CERN） は、スイスのジュネーヴ郊外でフランスと国境地帯にある、世界最大規模の素粒子物理学の研究所である。
「欧州合同原子核研究機構」、「欧州合同原子核研究機関」、「ヨーロッパ合同原子核研究機構」、または「欧州原子核共同研究所」などとも呼ばれる。研究内容が素粒子物理学を中心としていることから、「ヨーロッパ素粒子物理学研究所」、「欧州素粒子原子核研究機構」などの通称もある。
スイスのジュネーヴ西方にある、スイスとフランスの国境をまたぐ地域に、2つの研究地区といくつかの実験施設がある。
地下には 全周 27km の円形加速器・「LHC」が、国境を横断して設置されている。
研究地区は、スイス側にメイラン地区（ただし、敷地の一部はフランス領地）、フランス側にプレバサン地区がある。これら研究地区の外に広がる地下実験施設の運用、およびそこへの出入りのために、主にフランス側に実験地区が点在している。
正式名称は CERN （サーン、セルン）、もしくは英語で European Organization for Nuclear Research、フランス語で Organisation Européenne pour la Recherche Nucléaire がある。
別称として、European Laboratory for Particle Physics や Laboratoire Européen pour la Physique des Particules が用いられることもある。
"CERN" という名称は、本機構の開設準備のために設けられた組織のフランス語名称である Conseil Européen pour la Recherche Nucléaire の頭文字に由来する。これは、日本語では「研究所設立準備理事会」とも意訳されるが、より逐語的に訳せば「欧州原子核研究理事会」という意味である。この理事会が開設準備の役目を終えて解散し、研究所の名称が定まった以後も、呼称は CERN のままとなっている。
加速器を用いた素粒子物理学および原子核物理学の研究のほか、研究に必要な有用な技術の開発などを行っている。
文献の検索および連携のために考案された言語であるHTML 、インターネット通信のために定めた規則（Hypertext Transfer Protocol 通称：HTTP）、 World Wide Web（通称: ウェブ）発祥の地としても知られる。この発明はいずれもイギリス人技術者ティム・バーナーズ・リー(Tim Berners-Lee)によって考案された。当初、彼は各国に散らばっている実験者が瞬時に情報にアクセスできるように、しかも同時に多くのコンピュータ間で同じ情報が共有できるようにと願ってWebを開発したのであるが、彼のもたらした効果は今やCERNのみに留まらず、全世界に拡がっている。
CERN はメンバー国（欧州の20か国）により運営・利用されているが、それ以外の国々（非メンバー国）からの利用も受け入れている。
<Note.>オブザーバー国の位置づけは、その国を構成する団体から理事等の政治的な活動を行わなければならない人を受け入れないだけのことである。CERNの実験等に関する利用に関しては、各国の研究機関との間で締結した協定に基づき受け入れを行っている。なお、ECやユネスコがオブザーバー参加しているのは、公平中立性を確保するための、監査を行うためである。なぜならば、EC加盟国やUNESCO加盟国が不利な取り扱いを受けないか、国際条約に定められているところの危険な実験をおこなっていないか（具体的には、核実験）についてである。
メンバー国の利用者数（2002年）
| イギリス | 407 | デンマーク | 37 |
| イタリア | 1,249 | ドイツ | 710 |
| オーストリア | 70 | ノルウェー | 40 |
| オランダ | 115 | ハンガリー | 41 |
| ギリシャ | 73 | フィンランド | 72 |
| スイス | 257 | フランス | 877 |
| スウェーデン | 63 | ブルガリア | 23 |
| スペイン | 167 | ベルギー | 74 |
| スロバキア | 42 | ポーランド | 136 |
| チェコ | 103 | ポルトガル | 76 |
